NBD protein MSD protein SBP Protein DomainType Function
NBD1 NBD2 MSD1 TM EAA MSD2 TM EAA SBP1 SBP2
A. Importers
SMu0235 SMu0234 SMu0233 5 -2 SMu0232 4 -1 SMu0231   1 oligopeptide
                SMu0741     amino acid
                SMu1781     sugar
SMu1428   SMu1426 8 0 SMu1427 5 0 SMu1425   2 maltose
SMu0805   SMu0802 6 0 SMu0803 5 -1 SMu0801   2 melibiose/raffinose
SMu1762   SMu1761 3 -2       SMu1765 SMu1764 3 ???
                SMu0739     aspartate
SMu0884   SMu0886 5 -1 SMu0885 5 -1 SMu0887   2 spermidine/putresceine
SMu0849   SMu0848 4 0 SMu0847 3 0 SMu0846   2 glutamine/truncation
SMu0218   SMu0219 3 0       SMu0219   3 glutamine?
SMu1003   SMu1002 6 -1           3 choline????
SMu1380   SMu1382 4 0 SMu1383 4 0 SMu1381   2 amino acid
SMu1079   SMu1080 4 -1       SMu1078   3 amino acid
SMu1037 SMu1036 SMu1038 5 0 SMu1039 5 -1 SMu1040   1 phosphate
SMu0517   SMu0516 3 0           3 Glutamine
SMu0731   SMu0732 5 0       SMu0732   3 amino acid
    SMu1111 4 0       SMu1112     amino acid
SMu1518 SMu1517 SMu1520 7 -2 SMu1519 7 -2 SMu1521   1 branched chain amino acids
SMu1210   SMu1209 4 -1           3 FtsEX cell division
SMu1023 SMu1023 SMu1022 8 -2 SMu1021 8 -2 SMu1024   4 galactose
SMu0907   SMu0905 9 -2 SMu0906 8 -2 SMu0908   2 iron (III)
SMu0164   SMu0165 9         SMu0166   3 manganese ion
SMu0418   SMu0417 3 0       SMu0416   3 amino acid?
SMu1811   SMu1810 8         SMu1189   3 zinc ion
SMu0594   SMu0595 6 0       SMu0593   3 anion
SMu1920   SMu1921 5 -1 SMu1923 6 -1 SMu1922   2 glycine betaine/carnitine/choline
SMu1316   SMu1317 7 -2           3 Ribose???
B.Exporters
SMu1065 SMu1064 SMu1065 6 -2 SMu1064 6 -2     6 drug efflux
SMu0476 SMu0475 SMu0476 5 -2 SMu0475 6 -2     6 ???
SMu1093   SMu1094 6 -2           3 ???
SMu0786   SMu0787 4 -2           3 ???
SMu0916   SMu0917 10 -2 SMu0917         3 ???
SMu0729 SMu0729                   ???
SMu0986 SMu0987 SMu0986 6 -2 SMu0987 6 -2     6 ???
SMu0950   SMu0951 13 -2 SMu0951         8 ???
SMu1068   SMu1067 8 -1           3 ???
SMu0596   SMu0598 4   SMu0599 5 -2     3 ???
SMu1288   SMu1288 4 -2           5 ???
SMu1410   SMu1409 5             3 efflux
SMu1950 SMu1949 SMu1948 6             7 ???
SMu0971   SMu0970 6 0           3 glycine betaine
SMu1246   SMu1245 7 -1           3 ???
SMu1231   SMu1230 7 -1           3 ???
SMu0944   SMu0945 6 -2           3 ???
SMu1751   SMu1752 8 -1           3 ???
SMu1710   SMu1710 7 -2           5 ???
SMu0335   SMu0336 6 -2           3 ???
SMu0024                     ???
SMu1545   SMu1544 6 -2           3 ???
SMu0666   SMu0667 5             3 ???
SMu0752   SMu0751 5             3 ???
SMu1202   SMu1203 7             3 ???
    SMu1221 11 0 SMu1221           multidrug resistance
SMu0825 SMu0824 SMu0825 5 -2 SMu0824 6 -2     6 drug efflux
SMu0823 SMu0823       SMu0826 6       9 ???
SMu0836 SMu0837 SMu0836 4 -2 SMu0837 5 -2     6 ???
SMu0374   SMu0375 8 -2           3 ???
SMu1001   SMu1000 4 -2           3 ???
SMu0390   SMu0391 4 -2           3 ???
SMu1959 SMu1959 SMu1960 12 -2 SMu1960         11 ???
SMu1649   SMu1648 6 -1 SMu1647 6       2 ???
SMu1306 SMu1306                   ???
SMu0224                     ???
SMu0976   SMu0975 6             3 ???
SMu1050   SMu1051 6 -2 SMu1052 5       2 ???
SMu1757 SMu1757 SMu1756 5   SMu1758 4       4 ???
SMu0216   SMu0215 5             3 ???
SMu0258   SMu0258 6 -1       SMu0259 (MFP)   5 peptide toxin efflux
SMu1724   SMu1724 6 -2       SMu1726 (MFP)   5 peptide toxin efflux

The ABC transporters are split into importers and exporters. For each ABC transporter, the nucleotide-binding domains (NBD1 and NBD2), the membrane-spanning domains (MSD1 and MSD2), and the solute-binding proteins (SBP1 and SBP2) are reported. The functions were assigned based on the similarity searches against Genbank.

TM: Transmembrane segments predicted with the Psort program

EAA motifs predicted with the Pattern Search.